一、官吏素質低

元朝是少數民族政權，其利用少數蒙古貴族對漢族和其他民族進行殘酷統治，將人民分成四等，依序為蒙古人、色目人（西域的少數民族）、漢人（河兩岸的人）、南人（長江流域的漢族及少數民族），從中央到地方各級政權，重要官員幾乎都由蒙古人擔任，而省一級的長官則是由蒙古貴族世襲，所以部分蒙古貴族尚在兒童時期就可當封疆大吏，至於占據要職的蒙古人大多不懂漢語，也不會寫漢字，只靠蓋章畫押來處理公務，因此素質可想而知。

二、貴族腐化

從元武宗（第三個皇帝）開始，皇帝們一個比一個墮落，他們完全不會治國理財，但花起錢來卻是毫不手軟，武宗即位不到1年，光賞賜的錢就花了828萬錠，而當時國庫一年的收入僅有280萬錠，然而武宗的揮霍程度與下一任皇帝仁宗相比，卻還只是小巫見大巫，因為仁宗1年的花費就高達2000萬錠。

三、軍隊墮落

元朝初年南征北戰、銳不可當的怯薛軍，到了元末竟然白天在宮門宿衛，夜晚卻到郊外去搶劫，形同盜匪，而鎮戍地方的軍隊也不習武事，以至將官不知戰陣，士兵更不知彎弓射箭，導致元朝對外戰爭幾乎是次次失敗；1282年、1288年元朝軍隊2次征伐安南(今越南北部)、1284年遠征占城（今越南中南部）、1293年遠征爪哇（今印度尼西亞爪哇島）均以失敗告終。

四、天災頻仍

1333年京城大雨，多達48萬人成為饑民，1337年江浙二次受災，饑民更達到上百萬人，1344年，黃河連決三次，以至饑民遍地，在天災人禍的雙重逼迫之下，成千上萬的饑民只有鋌而走險，舉行起義。

1351年，元政府調集15萬民夫修治黃河，白蓮教首領韓山童在治黃工地上事先埋好一座獨眼的石人，刻上「莫道石人一隻眼，此物一出天下反」，以應驗一直流傳的「石人一隻眼，挑動黃河天下反」民謠，當石人被挖出，民夫們群情激奮，起義隨即爆發，緊接著全國其它地方的農民也相繼爆發起義，其中又以徐壽輝的南方紅巾軍，朱元璋、郭子興的紅巾軍等最有影響力，而農民起義不到16年，腐朽的元朝政府就被推翻了。